K-Dense-AI/drug-discovery-agent-skills
K-Dense-AI
Набор из 37 Agent Skills для разработки лекарств: хемоинформатика, докинг, молекулярная динамика, дизайн белков и графы знаний о мишенях.
Это коллекция навыков для кодинг-агентов, которая даёт им доступ к инструментам вычислительной химии и биологии. Нужна разработчикам и исследователям, которые хотят автоматизировать поиск и дизайн лекарств через агента.
Ключевые возможности
- 37 навыков по хемоинформатике, докингу, динамике и дизайну белков
- Соответствие открытому стандарту Agent Skills и Agent Plugins 1.0.0
- Совместимость с Claude Code, Cursor, Codex, Google Antigravity
- Сквозной пайплайн: от мишени до молекулы и проверки клинических данных
- Готовые инструкции по установке, API и параметрам инструментов
Для каких задач подходит
- Поиск мишеней с генетическими доказательствами и оценка их druggability
- Построение чистых датасетов из ChEMBL и их фильтрация
- Докинг малых молекул в структуру белка и предсказание аффинности
- Дизайн белков, антител, деградеров и олигонуклеотидов
- Анализ клинических и регуляторных данных по препаратам
Подробнее
Репозиторий содержит набор навыков (skills), которые описывают, как устанавливать и вызывать специализированные инструменты вычислительной химии и биологии. Каждый навык — это инструкция для агента: какие API использовать, какие параметры передавать и какие ограничения учитывать. Навыки собраны в переносимый пакет Agent Plugins, поэтому их можно подключить к разным агентам без привязки к конкретной платформе.
В отличие от отдельных библиотек, здесь навыки объединены в сквозные цепочки. Например, можно начать с поиска мишени по генетическим данным, затем проверить её на pan-essential, подобрать химические соединения и структуры, провести докинг и оценить дозу. Всё это выполняется последовательно, и агент сам решает, какие навыки задействовать. Такой подход снижает ручную работу по сборке пайплайна из разрозненных инструментов.
Стоит учитывать, что навыки требуют наличия соответствующих инструментов и данных, а качество результата зависит от корректности входных данных и выбранных параметров. Репозиторий распространяется под лицензией MIT, что допускает коммерческое использование.
Частые вопросы
Как установить drug-discovery-agent-skills?
Отдельной команды установки в README нет — склонируйте репозиторий и следуйте инструкции из README:
git clone https://github.com/K-Dense-AI/drug-discovery-agent-skills.gitКакие задачи решает drug-discovery-agent-skills?
Репозиторий решает задачи, связанные с разработкой лекарств: от валидации мишеней и анализа биоактивности до генеративного дизайна молекул, докинга, молекулярной динамики и дизайна белков. Он также помогает работать с клиническими и регуляторными данными, автоматизируя эти процессы через кодинг-агента.
Какие требования к окружению для использования этих навыков?
Навыки предназначены для кодинг-агентов, совместимых со стандартом Agent Skills, таких как Claude Code, Cursor, Codex или Google Antigravity. Для работы конкретных навыков могут потребоваться соответствующие инструменты и библиотеки, которые описаны в инструкциях.
Можно ли использовать репозиторий в коммерческих проектах?
Да, репозиторий распространяется под лицензией MIT, которая разрешает коммерческое использование при сохранении уведомления об авторских правах.
Чем этот набор отличается от простого использования библиотек вроде RDKit или DeepChem?
Навыки не заменяют библиотеки, а учат агента правильно их вызывать: содержат инструкции по установке, выбору API, параметрам и типичным ошибкам. Это позволяет агенту самостоятельно строить цепочки из нескольких инструментов без ручного написания кода.
О репозитории
Язык
Лицензия
Звёзды
48
Форки
5
Открытые issues
1
Контрибьюторы
0
Создан
16.08.2026
Обновлён
26.10.2026